关东军在武力侵略得手后，本庄、土肥原、板垣等人按照事先的计划立即着手制造傀儡政权。1931年12月15日，本庄繁命令在关东军司令部机关内，成立关东军统治部，以驹井德三为部长，代替原第三课，统治部下设行政、产业、财务、交通、交涉五个课，本庄繁也从一个单纯关东军司令官而成为具有殖民统治者的双重身份。日本几十年来对中国东北的领土野心，终于经本庄繁之手得以实现，日本朝野上下称本庄繁为满洲“建国之父”。历史事实充分证明本庄繁就是发动九一八事变，指挥日军侵占东北，炮制伪满傀儡政权的主要策划者之一。
本庄繁在任期间，关东军以板垣征四郎、石原莞尔及片仓衷等少壮派军人为代表的实权集团，主要依靠“满铁”及其法西斯组织“满洲青年联盟”、“大雄蜂会”。因此，本庄繁任关东军司令官期间，被日本政界、史学界等评价为：具有强烈主张实行国家主义的色彩。
在1931年12月8日的关东军参谋部第三课制定的《满蒙开发方策案》中，还出现了“不容许所谓资本家垄断经济利益”的字样。关东军某些主张和作法，理所当然地引起了日本财团、政府，乃至军部的不安。1932年6月26日，时任日军第十师团师团长广濑寿助对此评说：“（关东军）参谋们年少气锐而富于理想，招致了急进的坏影响”。
另外，由于关东军侵略得手后，作了极为乐观的估计。而中国人民抗日斗争的高涨，打破了关东军的乐观预料，受到冲击的关东军不得不重新考虑。例如，原认定依靠伪参议府的方式，是难以彻底实施日本的殖民统治，而改变为“总务厅”为中心的统治方式。所以在本庄繁任期的末期，迫于日本统治集团的压力和更好地进行对中国东北的殖民统治，关东军对其政策有所修正。
1932年7月，本庄繁任军事参议官，关东军司令官由武藤信义接任。与他一起调离的还有板垣征四郎、石原莞尔。1933年4月6日任日本天皇裕仁的侍从武官长，6月19日晋升为陆军大将。1934年4月29日授予勋一等旭日大绶章，功一级金鵄勋章。1935年12月26日被列为华族，授予男爵。
在日本陆军中参谋和主官的关系就是这样。仗打好了大家一起加官进爵。仗要是打输了主官肯定要倒霉，而参谋一般没什么事。这次满洲事变算是走运，关东军司令官本庄繁与坂垣征四郎、石原莞尔成了满洲英雄（由于板垣和石原在事件中的突出表现，得到了日本民众的一致叫好，日本著名音乐指挥家小泽征尔的名字就是在石原莞尔和板垣征四郎的名字中各取一个字），这几个本来是触犯了陆军刑法的家伙一下成了大功臣。
