有学者认为这个“不花贴木儿”就是淮王贴木儿不花。数十年之后，相继在蒙古草原叱咤一时的瓦剌太师也先、鞑靼太师孛来等风云人物，均曾经自称“淮王”，以示仿效先贤之意。
另外，以数百老弱残兵守卫顺承门的元平章朴赛因不花亦成为了战俘，其后被明军压送到齐化门杀死。史载他在明军主将之前显示了骨硬头的本色，只是敦促对方快点将自己杀死。主将本来下令留他于营中，有意进行招降。可他却宁死不屈。
除此之外，死于齐化门的还有赵国公丁好礼。他被明军俘虏之后，拒绝参拜军中大将，并厉声呵叱道：“我以小吏而步步高升，官居极品，爵位上公，如今年纪已老，只恨无以报国，所欠的唯有一死而已。”过了数日，明将又要召见他，他仍然不肯前往，但胳膊扭不过大脚，被士兵强行胁持到齐化门，最终因严辞抗辨而死在那里，时年七十五岁。
与丁好礼同时在齐化门被杀的还有蒙古人郭庸。《元史》记载丁好礼死亡的同一天，中书参知政事郭庸亦也被押至齐化门，在众将士喝其下跪受刑之时，仍然口硬地叫道：“做臣子的各为其主，死亡是我的本份，绝不拜跪！”
明军亦在齐化门处决叛徒。《明兴野记》记载“平章俞宝欲叛逃，但被捉获，徐达把他枭杀于齐化门，刖足以示众。”
前文提到，明军在追击元顺帝的途中，俘虏了很多回鹘人。明军欲将送这批回鹘人送回金陵。途经通州时，有回鹘人企图叛乱，不料因“事泄”，而“被杀戮五千余人”，“妻女俱配给军士。”徐达还下令：凡是元朝大小官员，皆要自首，藏匿于民籍中的，发现严惩不贷。军人们陆续将自首的前朝文武官吏押送回应天。元翰林待制黄殷仕，耻于抛头露面，投井而死。其他自杀的人员还有左丞丁敬可、太子司经郎拜住、大乐署令赵宏毅、总管郭充中等。
明军为了巩固政权，对大都周围的“团结”与“山寨”进行肃清作战。所谓的“团结”、“山寨”类似于乡兵团练，这是蒙古贵族为了对付各地的起义军而在1357年（至正十七年）让各路、府、州、县的地方官组建的。一些“团结”、“山寨”甚至设立万夫长、千夫长、百夫长等军衔，“编立牌甲，分守要害，互相策应。”
这些“团结”与“山寨”有的投降、有的抵抗到底。其中，元朝皇太子爱猷识理达腊在主持军务的时候曾经亲自命令院事、刑部尚书张庸练兵屯寨于房山。明军攻克大都之后，很多山寨放弃了抵抗。但是张庸不为所动，仍效忠元朝，集中兵力扼守骆驼谷这个险要处所，并派遣随从到山西向王保保求援。可是，援兵迟迟不来。在这种恶劣的环境之下，骆驼谷守军独木难支，遭到明军的围剿而全军溃败。坚守阵地的张庸的结局是被反水的寨民李世杰捉拿而献给明军，终被处死。
明军对顽固不化的“团结”与“山寨”是不会手软的，于八月十五日又攻克“宣德府怀来县与鸡鸣山寨”，在攻打这些山寨之时，因当地土人拒不投降，强行架梯攀登的明军得手之后尽屠守寨之人。
明朝牢牢控制了大都，将其改名为“北平”，并让华云龙出任大都督府佥事，同时兼职北平行省参知政事，总领六卫将士留守。孙兴祖领大都督分府事，统领燕山六卫三万余人协守。
当时北平城共有十一门，连同周围的地区达一百二十里，范围太大，不易防守。明军予以改建，从北平城中间的光熙门起，将城市截断为两部分，集中力量防守其中的一部分，以巩固防线。
大都之战结束后，明人在评价徐达在大都的所作所为时，认为这位开国元勋的对前朝政治中枢的政策是“封其府库、图籍、宝物及宫殿门，派兵守护。而前朝的宫人、嫔妃，则令其宦官守护，同时禁止滥杀无辜以及用暴力侵犯百姓。因而人民安居乐业，‘市不易肆’。为此，时人夸奖道‘曹彬下江南亦不过如此’。”曹彬是北宋开国名将，《宋史》称他在率军渡江平定南唐金陵时“不妄杀一人”，而徐达攻克大都之后是否也“不妄杀一人”？则见仁见智了。
